Здесь Экко еще дельфиненок — многого не умеет, да и сложные задачи ему не по плечу. Это сказалось на игре, которая вышла проще и безыскуснее, чем Ecco 1. Однажды, играя в догонялки с друзьями среди замшелых камней на мелководье, Экко наткнулся на странное стекловидное образование, загораживающее вход в подозрительную пещеру. Издав удивленный возглас, дельфин получил ответ кристаллического существа — кто бы мог подумать, что подобные «стекляшки» не только живут в океанах, но и организовали целую колонию-сеть, что связывает воедино все водоемы Земли. Хитрый дельфиненыш тут же поинтересовался насчет своей заветной мечты — увидеть воочию живую легенду Атлантики, кита Большого Синего, отдыхающего в обществе подруги жизни где-то неизвестно где. И ведь преуспел, шельма, в своих расспросах — даже больше: его новый знакомый согласился за небольшую плату перенести Экко и компанию в окрестности убежища кита посредством серии телепортаций.
